| 種名 | 科名 | 草木 | 採食部位 | 記録地 | 文献名 コード |
| シイ | ぶな | 木本 | - | 鹿児島県屋久島 | mo |
| シイタケ | キノコ | 菌類 | - | 宮城県金華山 | miya |
| シイタケ | キノコ | 菌類 | - | 大分県高崎山 | ta |
| シウリザクラ | ばら | 木本 | 新葉 | 下北半島南西域 | hoku |
| シウリザクラ | ばら | 木本 | 芽Bd | 下北半島南西域 | hoku |
| シウリザクラ | ばら | 木本 | 実Fr | 下北半島南西域 | hoku |
| シウリザクラ | ばら | 木本 | 樹液 | 下北半島南西域 | hoku |
| シオジ | もくせい | 木本 | 葉L | 東京都奥多摩 | to |
| シオジ | もくせい | 木本 | 芽Bd | 東京都奥多摩 | to |
| シオデ | ゆり | 草本 | 葉L | 千葉県房総半島 | ni |
| シオデ | ゆり | 草本 | 茎St | 千葉県房総半島 | ni |
| シキミ | もくれん | 木本 | 果実Fr | 京都府嵐山 | mo |
| シキミ | もくれん | 木本 | - | 京都府嵐山 | ara |
| シキミ | もくれん | 木本 | 果実Fr | 千葉県房総半島 | ni |
| シキミ | もくれん | 木本 | 葉L | 千葉県房総半島 | ni |
| シシウド | せり | 草本 | 茎St | 愛知県額田町 | ai |
| シシウド | せり | 草本 | 茎St | 愛知県額田町臼子 | ai |
| シシウド | せり | 草本 | 髄Pi | 下北半島脇野沢 | hoku |
| シシウド | せり | 草本 | 茎St | 長野県志賀 | ya |
| シシウド | せり | 草本 | 葉L | 長野県志賀 | ya |
| シシウド | せり | 草本 | 茎St | 長野県志賀 | ya |
| シシウド | せり | 草本 | 葉L | 長野県志賀 | ya |
| ジシバリ | いね | 草本 | 地上部 | 宮城県金華山 | miya |
| シソ科sp | しそ | 草本 | 葉L | 大阪府箕面 | mino |
| シダ類 | ？ | シダ類 | 葉L | 下北半島南西域 | hoku |
| シナノキ | しなのき | 木本 | 葉L | 下北半島南西域 | hoku |
| シナノキ | しなのき | 木本 | 種子Sd | 下北半島南西域 | hoku |
| シナノキ | しなのき | 木本 | 樹皮Bk | 下北半島南西域 | hoku |
| シナノキ | しなのき | 木本 | 芽Bd | 下北半島南西域 | hoku |
| シナノキ | しなのき | 木本 | 樹皮Bk | 下北半島脇野沢 | wa |
| シナノキ | しなのき | 木本 | 芽Bd | 下北半島脇野沢 | wa |
| シナノキ | しなのき | 木本 | 髄Pi | 下北半島脇野沢 | hoku |
| シナノキ | しなのき | 木本 | 若葉ｙL | 長野県志賀 | ya |
| シナノキ | しなのき | 木本 | 若葉ｙL | 長野県志賀 | ya |
| シナノキ | しなのき | 木本 | 樹皮Bk | 長野県志賀 | ya |
| シナノキ | しなのき | 木本 | 芽Bd | 長野県志賀 | ya |
| シバ | いね | 草本 | 地上部 | 宮城県金華山 | miya |
| シバヤナギ | やなぎ | 木本 | 葉L | 千葉県房総半島 | ni |
| シバヤナギ | やなぎ | 木本 | 葉柄Pt | 千葉県房総半島 | ni |
| シマサルナシ | またたび | 木本 | - | 鹿児島県屋久島 | mo |
| シャシャンボ | つつじ | 木本 | - | 鹿児島県屋久島 | mo |
| ジャガイモ | なす | 草本 | - | 湯河原･小田原 | shi |
| ジャケツイバラ | まめ | 木本 | 種子Sd | 千葉県房総半島 | ni |
| ジャニンジン | あぶらな | 草本 | 種子Sd | 愛知県額田町臼子 | ai |
| ジャノヒゲ | ゆり | 草本 | 葉L | 岡山県臥牛山 | ga |
| ジャノヒゲ | ゆり | 草本 | - | 湯河原･小田原 | shi |
| ジャノヒゲ | ゆり | 草本 | 葉L | 千葉県房総半島 | ni |
| シュリガイ | 貝 | 動物類 | - | 下北半島 | mo |
| シュンラン | らん | 草本 | 葉L | 千葉県房総半島 | ni |
| ジュズスゲ | かやつりぐさ | 草本 | - | 京都府嵐山 | mo |
| ショウジョウバカマ | ゆり | 草本 | 花Fl | 愛知県額田町 | ai |
| ショウジョバカマ | ゆり | 草本 | 花Fl | 愛知県額田町臼子 | ai |
| シラカシ | ぶな | 木本 | 種子Sd | 東京都奥多摩 | to |
| シラカシ | ぶな | 木本 | 果実Fr | 千葉県房総半島 | ni |
| シラカシ | ぶな | 木本 | 葉L | 千葉県房総半島 | ni |
| シラカシ | ぶな | 木本 | 樹皮Bk | 千葉県房総半島 | ni |
| シラカンバ | かばのき | 木本 | 樹皮Bk | 長野県志賀 | ya |
| シラキ | とうだいぐさ | 草本 | 葉L | 千葉県房総半島 | ni |
| シラキ | とうだいぐさ | 草本 | 枝Br | 千葉県房総半島 | ni |
| シラネセンキュウ | せり | 草本 | 茎St | 長野県志賀 | ya |
| シラネセンキュウ | せり | 草本 | 葉L | 千葉県房総半島 | ni |
| シラネセンキュウ | せり | 草本 | 茎St | 千葉県房総半島 | ni |
| シラン | らん | 草本 | 葉L | 千葉県房総半島 | ni |
| シリブカガシ | ぶな | 木本 | 実Fr | 愛知県額田町 | ai |